晚唐北宋以來，儒學復興，吸收融攝佛道二教而形成新儒學。儒家學說更適合維護封建統治秩序的需要，因此在當政者大力提倡下，其社會地位日漸提高，迫使佛道二教向儒家靠攏，形成三教合流的社會思潮。宋元道教內丹、符?諸道派，皆不同程度地吸收融會儒家思想，并且孕育產生了堪稱儒道融合典型的道派——凈明道。
凈明道主要流傳于江西南昌地區，托稱其道法出自東晉道士許遜。許遜的信仰由來已久，隋唐時期在南昌西山游帷觀盛行的孝道派，即奉許遜為祖師。游帷觀后改稱玉隆觀。宋徽宗政和二年(1112)，敕封許遜為“神功妙濟真君”，并擴建西山玉隆觀，建成包括六殿六閣，七樓七門，共計有三大院落的宏偉建筑群。宋徽宗親賜匾額“玉隆萬壽宮”。宋元凈明道派即以此處為傳播中心。南宋初，在金兵壓境，家國不寧的氣氛中，有周真公、何真公等人在西山祈禱許遜。據說許真君等六位真人于宋室南渡之年(1127)降神于渝水，“出示靈寶凈明秘法，化民以忠孝廉慎之教”。后二年，許真君又降臨游帷故地(即西山玉隆萬壽宮)，降授飛仙度人經，凈明忠孝大法。于是周真公等人在玉隆萬壽宮建立翼真壇，傳度弟子五百余人，形成一個新道派。現存于《道藏》中的《太上靈寶凈明秘法》《太上靈寶凈明飛仙度人經法》《靈寶凈明黃素書》等十余種凈明道書，當即南宋初周真公所傳。從書中可知周真公凈明道主要傳行一種新符?“凈明秘法”，假托其法出自“太陽真君孝道明王”。凈明秘法與神霄、清微等新符?派的道法相似，也重視內丹與心性修煉，調養心性，使之纖塵不染，無幽不燭，是謂凈明。以清靜無染的真心本性作為施符念咒、存神感靈之根本，又特重忠孝廉慎等倫理教化。因此，凈明法大抵“以孝悌為之準式，修煉為之方術”，有儒道結合的特點。
周真公一派傳行不久，便不再見于記載。到了元初，在南昌西山又出了一位隱居儒士劉玉(1257—1308)。此人幼讀詩書，年僅弱冠而父母雙亡，因家貧力耕而食，視塵世不足為，乃熱衷于神仙之學。他自稱于至元十九年(1282)遇見凈明法師胡慧超，預告凈明大教將興，五陵之內當出八百弟子，以劉玉為師。元貞二年(1296)他又自稱許真君親降其家，授以中黃大道、八極真詮和《靈寶壇記》。于是劉玉乃“開闡大教，誘誨后學”，以神授旨義教化鄉人，并為人祈禱禳解，一時從學者頗多，遂形成新的凈明道派。劉玉開創的新凈明道，以許遜為第一代祖師，自己為第二代，不承認與南宋周真公凈明道有傳承關系。但從其學說淵源看，實為周真公舊凈明道的發展。劉玉臨終前以教事傳付弟子黃元吉。黃元吉(1271—1325)字希文，號中黃先生。出身江西豐城望族，十二歲即入西山五隆萬壽宮為道士，后隨侍劉玉，受其器重。他掌教后，在西山建玉真、隱真、洞真三壇傳度弟子。并于至治三年(1323)游歷京師，宣揚凈明教旨，兼行祈禳之事，公卿士大夫多禮問之，莫不嘆異。玄教大宗師張留孫薦之于上，朝廷賜以璽書。繼黃元吉掌教的第三代凈明宗師徐慧(1291—1350)，一名徐異，號丹扃道人。其人長于文學，在京師與士大夫交游，朝廷賜號“凈明配道格神昭效法師”。他編輯凈明道諸位祖師傳記、神降法語及劉玉、黃元吉語錄，著成《凈明忠孝全書》六卷。徐慧之后，凈明道傳承法嗣不明。相傳元末明初道士趙宜真為凈明第四代嗣師，但趙宜真主要傳承清微、全真派道法，與徐慧并無師承關系。大概西山凈明派后來歸入全真道，但當地朝拜許真君習俗，仍一直保持。
凈明道教義以融攝儒道為特色，自稱其教名為“凈明忠孝道”。元人虞集說：“蓋其說以本心凈明為要，而制行必以忠孝為貴而已。”《凈明忠孝全書》也稱劉玉立教“以忠孝為本，敬天崇道，濟生度死為事”。所謂凈明，是指先天無極大道及自我清靜本心。凈明家認為大道清虛無為，人心本來清凈光明，與道相通。但因世人生來多漸染熏習，縱忿恣欲，背卻本性，使心地不凈不明，以致曲味道理，便不得為人之道。對治世人心病，恢復本性凈明的辦法，唯有懲忿窒欲，正心誠意。收攝心念，使之不為物欲所動。所謂懲忿者，不僅要息滅心中嗔怒仇恨，而且要懲治嫉妒偏狹、猜疑察察之心，對細小的忿嫉也不放過。所謂窒欲者，不僅要斷絕淫邪色欲，而且對涉及溺愛眷戀、滯著事物之間的一切欲望，皆須窒塞。唯有懲治一切物欲貪念，使內心纖塵不染，改過遷善，明理復性，方可德配天地，無愧人道。“不用修煉，自然道成”。
凈明道提倡忠孝，以“忠孝廉慎寬裕容忍”八字作為許真君降授的“垂世八寶”。尤其對忠孝神化到無以復加的程度，宣稱“忠孝大道之本也”；“孝至于天，日月為之明；孝至于地，萬物為之生；孝至于民，人道為之成。”又說忠孝為人性中固有的良知良能，“人人具此天理，非分外事也。”劉玉還強調提倡忠孝，扶植綱常不只是一句空話，而且必須“真踐實履”。這種態度使當時許多儒家大臣也不得不佩服稱嘆，認為有益于世道人心。凈明道雖極力附合儒學，但畢竟屬于符?道派，因此較儒家多了些驅邪禳災的本領，不過其符?道法也強調先正其內，后治其外，要行法者著眼于懲忿窒欲的內功，以凈明之心為畫符念咒之本，而對法術儀式則盡量簡化。這一特點與神霄、清微等道派大體相似。
